单纯质谱分子量（MS）检测不能完全证明合成序列的正确性，质谱测序则可以保证产品中序列排布和修饰的正确性。质谱测序通过实际检测获得的子离子信息与理论序列的子离子匹配，从而达到质谱测序的功能。

检测分析流程：

LC MSMS检测 → 提取离子流信息 → MSMS匹配信息 → 实验数据与理论数据匹配 → 输出序列匹配结果 

方法优势：

• 支持全长序列及其修饰的鉴定
• 检测速度快，快至1h内出报告
• 质量精准度可高达10ppm以内

200nt 以内的RNA, 100nt以内的DNA可达100%的序列覆盖度，例如：sgRNA，siRNA，ASO等  

200nt以上的RNA可达80%以上的序列覆盖度，例如mRNA