服务内容

Next-Generation Sequencing (NGS)

订购讯息

质粒长度 (bp)	价格	交付周期（工作日）
≤ 5kb	¥58	3
5-20kb	¥108
20-35kb	¥168
> 35kb	联系尊龙凯时人生就是搏

交付内容

• excel 报告: 包含测序数据量、质控结果、比对结果、变异结果
• pdf 报告：将excel中的关键结果、具体的变异位点以及质粒测序深度模式图整合生成该报告
• gbk 文件：由 pLannotate注释生成包含质粒中每个原件的GenBank 文件

* 联系尊龙凯时人生就是搏索取样本报告

Oxford Nanopore Technologies (ONT)

订购讯息

质粒长度 (bp)	价格	交付周期（工作日）
2.5-25kb	¥140	2
25-125kb	¥280
125-300kb	¥560

交付内容

• Nanopore_result.pdf: 原始数据的质量控制结果，参考序列的比对结果，和变异检测结果
• Nanopore_result.xlsx: 原始数据的质量控制结果、变异检测结果、每个位点的测序深度，和检测到的碱基类型的统计数据
• vars_pLann.gbk: 质粒功能元素（由pLannotate注释）、变异检测结果（包括结构变异）和参考序列组成
• pLann.html: 质粒示意图
• .final.fa : 重建的DNA序列用突变碱基替代参考序列中的碱基，只有具有高置信度且突变频率大于60%的突变才用于替代
• NanoPlot-report.html: 由NanoPlot生成的原始数据的质量控制结果
• .fastq file: raw data: 联系尊龙凯时人生就是搏索取

* 联系尊龙凯时人生就是搏索取样本报告

常见问题解答 (FAQ)

• 1. 收样标准？

  NGS 收样标准

  质粒长度 (bp)	浓度	容量
  ≤ 5kb	10 ng/μL	≥20 μL
  5-20kb
  20-35kb

  溶剂：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶剂中不能含有EDTA）
  浓度：	浓度必须采用Qubit，不能使用Nanodrop进行检测
  纯度：	建议 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送测样本必须是单克隆质粒，若是混合物，可能会造成结果不准确
  完整度：	建议采用琼脂糖凝胶电泳对质粒进行检测，判断是否存在降解情况，质粒降解可能会造成测序失败
  寄送方式：	干冰

  Nanopore 收样标准 

  质粒长度 (bp)	浓度	容量
  ＜20 kb	30 ng/μL	≥10 μL
  20-100 kb	50 ng/μL	≥20 μL
  100-300 kb	50 ng/μL	≥40 μL

  溶剂：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶剂中不能含有EDTA）
  浓度：	浓度必须采用Qubit，不能使用Nanodrop进行检测
  纯度：	建议 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送测样本必须是单克隆质粒，若是混合物，可能会造成结果不准确
  完整度：	建议采用琼脂糖凝胶电泳对质粒进行检测，判断是否存在降解情况，质粒降解可能会造成测序失败
  寄送方式：	干冰

• 2. 如何订购全质粒测序服务？

  您可以将全质粒测序服务与您的基因合成和质粒制备项目捆绑，或者将样本寄给尊龙凯时人生就是搏。

• 3. 你是如何对样本进行测序的？

  在尊龙凯时人生就是搏，尊龙凯时人生就是搏采用先进的测序技术和方法对您的质粒样本进行测序。尊龙凯时人生就是搏拥有全面的测序平台（Sanger测序，NGS，Nanopore），可以为您的质粒提供完整准确的序列分析，无论您是否处理大质粒或难以测序的区域，如ITR和GC-rich区域。

• 4. 为什么需要对质粒全长进行测序?
  1. 验证序列完整性：质粒在克隆或扩增过程中可能会发生遗传修饰，导致潜在的序列错误或不希望的突变。
  2. 克隆和工程的质量控制：测序质粒作为质量控制步骤，用于验证克隆插入物的准确性，确认不存在不需要的突变，并确保实验系统的完整性。
  3. 优化实验设计：准确了解质粒序列使您能够更有效地设计实验。
• 5. 测序结果的准确性如何?

  目前的碱基准确性大于95%，并且可通过一致性序列进行矫正，矫正后的准确率可达99.9%。

• 6. 测序失败的原因有哪些?

  所有序列未达到30xcoverage即说明测序失败，造成建库失败的主要原因有：未按照要求用Qubit检测浓度，存在基因组和质粒的片段，其它质粒杂质，存在质粒降解的现象，所以建议客户送样前确定样本是否达标。

• 7. 您能否修复全质粒测序中检测到的突变？

  是的，通过使用GenScript的定点突变服务，您可以受益于尊龙凯时人生就是搏的专业知识和简化流程，旨在提供快速的交付时间、节省成本，并在引入或修复突变时保持高准确性。